Bij mij loste het probleem (zichzelf) op door Akismet te updaten – er stonden 2-update meldingen: WP zelf (naar 3.9) en Akismet. Nadat ik naar 3.9 had geupdate, kreeg ik de foutmelding ‘er is iets fout gegaan – opnieuw bijwerken’ – terwijl 3.9 wel was geinstalleerd en rechts-onderin staat vermeld.
Akismet (niet geactiveerd) update deed de foutmelding verdwijnen.