WordPress als CMS voor eigen template

Sinds kort ben ik voor CMS toepassingen overgeschakeld op WordPress. Ik had een eigen website gemaakt die ik nu geïmplementeerd heb in WordPress.

Wat heb ik gedaan om wordpress te installeren:
ik heb volgende tutorial gevolgd: http://blog.teamtreehouse.com/responsive-wordpress-bootstrap-theme-tutorial (daar ik met bootstrap werk)

Ik heb nu een header.php, een footer.php en een index.php. Ik heb ook reeds al enkele “Pages” aangemaakt en dit werkt ook perfect.

Zelf zit ik met 2 belangrijke vragen:

1. Hoe zit het met de hiërarchie? Wanneer moet je index.php veranderen naar pages.php, wanneer moet je home.php gebruiken? Voor mij is dit nogal moeilijk te begrijpen als ik de WordPress tutorial lees.

2. Ik ben opzoek hoe ik enkele pages kan voorzien van een eigen php code (500 regels groot) iedere pagina heeft zijn unieke code. Ik las om gebruik te maken van “templates”, maar vrees als mijn hiërarchie niet correct is dat dit ook niet zal lukken

Het zou leuk zijn als iemand me in de goede richting kan duwen.

Bedankt op voorhand!