Om hierin te kunnen adviseren zou ik inzicht moeten hebben in de theme bestanden. Zorg er in ieder geval voor dat je in de include bestanden met een eigen <div> start en ook weer afsluit </div>.
En verder is het natuurlijk goed om deze pagina te raadplegen: http://codex.wordpress.org/Theme_Development
Bedankt voor de reactie. Inmiddels heb ik het na lang zoeken gevonden. Trial and error.
Ik moest op verschillende plaatsten (single.php, page.php enz) voor de functie getFooter een </div> plaatsen en nu gaat het goed. Nogmaals dank.
Bedankt voor de tip en url. Ik ga gewoon verder met bouwen en dan ga ik de handleiding volgen.